Demnach werden beim Update auf High Sierra alle Daten automatisch in das neue System konvertiert. Nutzer werden keine Auswahlmöglichkeit erhalten. Apple verspricht sich vom Umstieg auf das Apple File System Platzersparnis, Mehr Sicherheit und Geschwindigkeit.

Nutzer von Apple-Rechnern mit magnetischen Festplatten oder Hybrid-Speichern sind laut einem Bericht der Fachzeitschrift „Mac&i“ von der automatischen Umstellung nicht betroffen.

Die Umstellung vom bisherigen Dateisystem HFS+ auf APFS hat für Nutzer direkte Auswirkungen. APFS-formatierte Datenträger können nur von APFS-Systemen und macOS-Versionen ab 10.12.6 gelesen und geschrieben werden. Hierdurch könnte der Dateiaustausch mit anderen Rechnern über USB-Sticks oder externe Festplatten eingeschränkt werden.

Außerdem lohnt vor dem Umstieg auf das neue Betriebsystem und das neue Dateisystem eine vollständige Sicherung aller Daten - etwa über Apples eigenes System TimeMachine. Sollte bei der Konvertierung der Daten etwas schief gehen, kommt es so zu keinem Datenverlust.

Auf iPhone und iPad ist APFS seit iOS-Version 10.3 etabliert. Vor dem Umstieg hatte Apple offenbar geheime Tests auf Nutzergeräten durchgeführt, um mögliche Probleme auszuschließen. Bis auf einige Probleme bei der Bereitstellung von Dateien und bei Dateien mit ungewöhnlichen Zeichen im Namen verlief der nach bisherigen Erkenntnissen unauffällig.