Selbst wer nicht wahnsinnig viele E-Mails bekommt, kann im Nachrichteneingang den Überblick verlieren. Besser ist daher, ein wenig Arbeit in ein vernünftiges Ordnungssystem zu investieren. E-Mail-Programme und einige Webmailer bieten dafür die Möglichkeit, Ordner einzurichten - zum Beispiel „Berufliches“, „Familie“ und „USA-Reise“. In die verschiebt der Nutzer dann seine Nachrichten einfach per Drag and Drop.

Etwas aufwendiger ist es, sogenannte Filterregeln aufzustellen - dafür spart man sich damit später das manuelle Sortieren von E-Mails. Mit Filtern werden Nachrichten von bestimmten Absendern oder mit bestimmten Begriffen automatisch in den richtigen Bereich verschoben. Die Funktion gibt es ebenfalls bei vielen Diensten und Programmen, oft auch mit Assistenten, die unerfahrene Nutzer beim Einrichten unterstützen.