1988 feierte der Werksclub mit dem Gewinn des UEFA-Cups den größten internationalen Erfolg. Bayer 04 hat in dieser Saison zum zwölften Mal das Achtelfinale eines europäischen Titelkampfes erreicht. Im Hinspiel unterlagen die Leverkusener Paris St. Germain mit 0:4.
Das Abschneiden in den europäischen Wettbewerben seit 2003: