Der Spanier war im vergangenen Monat beurlaubt worden.
Nun wurde eine Einigung über die Vertragsauflösung erzielt. Becker hatte unter anderem das Frauen-Team des Landes trainiert und es 2012 zur Afrika-Meisterschaft geführt. Zuvor war er beim Verband Technischer Direktor.
Äquatorialguinea war ursprünglich vom Afrika-Cup ausgeschlossen worden, weil es nicht-spielberechtigte Spieler in der Qualifikation eingesetzt hatte. Afrikas Kontinental-Verband hob die Sperre wieder auf, nachdem das Land kurzfristig als Ersatz-Gastgeber für Marokko eingesprungen war. Das Turnier beginnt am 17. Januar und endet am 8. Februar.