Die Trennung erfolge im gegenseitigem Einvernehmen, teilte der Club auf seiner Internetseite mit. Ein Nachfolger wurde vorerst nicht benannt.
Peseiro, dessen Zwei-Jahres-Vertrag noch bis Juni 2014 lief, hatte Braga diese Saison zum Gewinn des portugiesischen Ligapokals geführt. In der Champions League waren die Nordportugiesen schon in der Gruppenphase gescheitert. In der Liga verpasste man zudem Platz vier die vom Verein angestrebte Qualifikation für die europäische Königsklasse.
Der international erfahrene Peseiro hatte in den vergangenen Jahren unter anderen Panathinaikos Athen, Rapid Bukarest und die Nationalmannschaft von Saudi-Arabien gecoacht.