Die Deutsche Bahn hat ihre Kulanzregelungen für vom Hochwasser betroffene Fahrgäste bis zum 23. Juni verlängert. Fallen Züge wegen der Flutschäden aus oder verspäten sich stark, werden zuggebundene Fahrkarten für die nächstmögliche Verbindung umgeschrieben. Dabei kann auch ein höherwertiger Zug genutzt werden. Galt die Buchung also zum Beispiel für einen IC, ist eine Fahrt im ICE möglich.

Tickets und Reservierungen für Reisen in oder aus den Hochwassergebieten werden auf Wunsch kostenfrei erstattet. Für die Rückgabe von Online-Tickets müssen Fahrgäste im Internet ein Formular ausfüllen. Wurden die Fahrkarten im Reisezentrum oder am Automaten gekauft, sind die Mitarbeiter im Reisezentrum die richtigen Ansprechpartner.

Keinen Anspruch haben Reisende auf die sonst übliche Entschädigung bei massiven Verspätungen. Da es sich bei dem Hochwasser um höhere Gewalt handelt, muss die Bahn nicht zahlen.

Weiterhin hat die Bahn eine kostenlose Hotline geschaltet. Diese ist rund um die Uhr unter 08000/99 66 33 erreichbar. Kunden im Ausland werden Informationen unter der Nummer 0049/1805/33 44 44 erteilt (Gebühren je nach Herkunftsland und Provider).

Informationen darüber, welche Bahnstrecken betroffen sind, liefert auch die Webseite der Bahn. Vor allem in Oberbayern, weiten Teilen Sachsens, Thüringens und im südlichen Sachsen-Anhalt gibt es Einschränkungen.